Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms