Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1Q8VDF2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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