Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Slc6a20aQ8VDB9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Slc6a20aQ8VDB9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms