Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Fam20bQ8VCS3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Fam20bQ8VCS3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Fam20bQ8VCS3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Fam20bQ8VCS3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Fam20bQ8VCS3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Fam20bQ8VCS3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Fam20bQ8VCS3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam20bQ8VCS3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Fam20bQ8VCS3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Fam20bQ8VCS3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Fam20bQ8VCS3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Fam20bQ8VCS3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Fam20bQ8VCS3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Fam20bQ8VCS3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fam20bQ8VCS3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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