Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH9

Lrrc3b, Leucine-rich repeat-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc3bQ8VCH9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc3bQ8VCH9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc3bQ8VCH9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms