Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef3Q8VCC8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef3Q8VCC8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef3Q8VCC8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef3Q8VCC8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef3Q8VCC8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef3Q8VCC8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms