Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ApobrQ8VBT6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ApobrQ8VBT6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms