Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc12Q8R344 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms