Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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