Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Lrrtm1Q8K377 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Lrrtm1Q8K377 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrtm1Q8K377 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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