Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nsl1Q8K305 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsl1Q8K305 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms