Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrdQ8K2M3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrdQ8K2M3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrdQ8K2M3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrdQ8K2M3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrdQ8K2M3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrdQ8K2M3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrdQ8K2M3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrdQ8K2M3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrdQ8K2M3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrdQ8K2M3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrdQ8K2M3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrdQ8K2M3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrrdQ8K2M3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SrrdQ8K2M3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms