Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms