Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtmr3Q8K296 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms