Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf3c1Q8K284 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf3c1Q8K284 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms