Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcf3Q8K268 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms