Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d5Q8JZW5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms