Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
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Afg3l2Q8JZQ2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Afg3l2Q8JZQ2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Afg3l2Q8JZQ2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Afg3l2Q8JZQ2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms