Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LgsnQ8CIX8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LgsnQ8CIX8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms