Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SbsnQ8CIT9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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