Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CopaQ8CIE6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms