Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upp2Q8CGR7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms