Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcerg1Q8CGF7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcerg1Q8CGF7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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