Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Colec10Q8CF98 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Colec10Q8CF98 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Colec10Q8CF98 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Colec10Q8CF98 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Colec10Q8CF98 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Colec10Q8CF98 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Colec10Q8CF98 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Colec10Q8CF98 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec10Q8CF98 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms