Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms