Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms