Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms