Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc87Q8CDL9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc87Q8CDL9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms