Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl3Q8CD19 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lancl3Q8CD19 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms