Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccdc187Q8C5V8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccdc187Q8C5V8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc187Q8C5V8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc187Q8C5V8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc187Q8C5V8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc187Q8C5V8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc187Q8C5V8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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