Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ubqln3Q8C5U9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ubqln3Q8C5U9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ubqln3Q8C5U9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ubqln3Q8C5U9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ubqln3Q8C5U9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ubqln3Q8C5U9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ubqln3Q8C5U9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ubqln3Q8C5U9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ubqln3Q8C5U9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ubqln3Q8C5U9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ubqln3Q8C5U9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ubqln3Q8C5U9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ubqln3Q8C5U9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubqln3Q8C5U9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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