Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc90bQ8C3X2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms