Protein–RNA interactions for Protein: Q8C166

Cpne1, Copine-1, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne1Q8C166 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne1Q8C166 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne1Q8C166 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne1Q8C166 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne1Q8C166 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne1Q8C166 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne1Q8C166 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne1Q8C166 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cpne1Q8C166 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne1Q8C166 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne1Q8C166 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cpne1Q8C166 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms