Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cldn17Q8BXA6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cldn17Q8BXA6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cldn17Q8BXA6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cldn17Q8BXA6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cldn17Q8BXA6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cldn17Q8BXA6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cldn17Q8BXA6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cldn17Q8BXA6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cldn17Q8BXA6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cldn17Q8BXA6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cldn17Q8BXA6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cldn17Q8BXA6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn17Q8BXA6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cldn17Q8BXA6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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