Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms