Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctdsp2Q8BX07 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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