Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms