Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Catsper4Q8BVN3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms