Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp398Q8BV16 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms