Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pggt1bQ8BUY9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms