Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ubr7Q8BU04 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubr7Q8BU04 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms