Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rccd1Q8BTU7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rccd1Q8BTU7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rccd1Q8BTU7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rccd1Q8BTU7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rccd1Q8BTU7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rccd1Q8BTU7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rccd1Q8BTU7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rccd1Q8BTU7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rccd1Q8BTU7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rccd1Q8BTU7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rccd1Q8BTU7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rccd1Q8BTU7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rccd1Q8BTU7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rccd1Q8BTU7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.9 ms