Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms