Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gga3Q8BMI3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms