Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Prpf18Q8BM39 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Prpf18Q8BM39 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Prpf18Q8BM39 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Prpf18Q8BM39 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Prpf18Q8BM39 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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