Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp54Q8BL06 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp54Q8BL06 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms