Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zcchc4Q8BKW4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zcchc4Q8BKW4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms