Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rufy1Q8BIJ7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy1Q8BIJ7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms