Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX0

Trim23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim23Q8BGX0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim23Q8BGX0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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