Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Atg4bQ8BGE6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Atg4bQ8BGE6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Atg4bQ8BGE6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Atg4bQ8BGE6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Atg4bQ8BGE6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Atg4bQ8BGE6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Atg4bQ8BGE6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Atg4bQ8BGE6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Atg4bQ8BGE6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Atg4bQ8BGE6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Atg4bQ8BGE6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Atg4bQ8BGE6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Atg4bQ8BGE6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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